DNA和蛋白质序列数据分析工具（第二版） pdf snb 115盘 kindle 在线 下载 pmlz mobi

在众多生物基因组测序项目完成之际，我们面临的*挑战是如何对DNA和蛋白质数据进行科学的分析和注释。本书分三个层次解读基因数据库和网络工具：基因组学层面重点介绍序列比对工具BLAS丁和CltlstalX的使用、真核生物基因结构的预测、电子克隆及分子进化遗传分析工具(MEGA 4)的使用；蛋白质组学层面介绍了蛋白质结构与功能预测、序列模体的识别和解析、蛋白质谱数据分析、基因芯片数据处理和分析，以及应用GO注释基因功能和通过KEGG分析代谢途径：系统生物学层面从网络结构分析阐述了蛋白质与蛋白质的相互作用；此外，还增添了使用Bioperl模块进行数据分析和Windows操作系统下Bioperl程序包的安装等内容。书中提及的各种方法均有充实的例证并附卜相关数据和图表，供读者理解和参考：书后还附有中英文的专业术语和词汇。

本书可作为对生物信息学专业感兴趣的本科生、研究生和研究人员学习、研究的重要工具手册。

第二版前言

版前言

第1章 序列比对工具BLAST和ClustalX的使用

1.1 序列比对BLAST

1.1.1 Basic BLAST

1.1.2 网上blastx比对

1.1.3 网上PSl.Blast比对

L.1.4 Specialized BLAST

1.1.5 网上Blast2比对

1.2 本地运行BLAST(Windows系统)

1.2.1 BLAST程序下载

1.2.2 BLAST程序安装

1.2.3 进入DOS命令行提示符状态

1.2.4 搜索数据库的格式化

1.2.5 BLAST搜索程序运行

1.2.6 本地化BLAST搜索结果查看

1.3 多序列比对(ClustalX)

1.3.1 ClustalX的使用

1.3.2 数据的输入

1.3.3 数据的输出

主要参考文献

第2章 真核生物基因结构的预测

2.1 基因可读框的识别

2.2 CpG岛、转录终止信号和启动子区域的预测

2.2.1 CpG岛的预测

2.2.2 转录终止信号的预测

2.2.3 启动子区域的预测

2.3 基因密码子偏好性计算：CodonW的使用

2.4 采用mRNA序列预测基因：Spidey的使用

2.5 ASTD数据库简介

主要参考文献

第3章 电子克隆

第4章 分子进化遗传分析工具的使用

第5章 蛋白质结构与功能预测

第6章 序列模体的识别和解析

第7章 蛋白质谱数据分析

第8章 基因芯片数据处理和分析

第9章 应用GO注释基因功能和通过KEGG分析代谢途径

第10章 系统生物学网络结构分析

第11章 使用Bioperl模块作数据分析

第12章 Winodws环境下Bioperl程序包的安装

英汉对照词汇

彩图

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书籍介绍

《DNA和蛋白质序列数据分析工具(第2版)》内容简介：在众多生物基因组测序项目完成之际，我们面临的最大挑战是如何对DNA和蛋白质数掘进行科学的分析和注释。《DNA和蛋白质序列数据分析工具(第2版)》分三个层次解读基因数据库和网络工具：基因组学层面重点介绍序列比对工具BLAST和ClttstalX的使用、真核生物基因结构的预测、电子克隆及分子进化遗传分析工具(MEGA4)的使用；蛋白质组学层面介绍了蛋白质结构与功能预测、序列模体的识别和解析、蛋白质谱数据分析、基因芯片数据处理和分析，以及应用GO注释基因功能和通过KEGG分析代谢途径；系统生物学层面从网络结构分析阐述了蛋白质与蛋白质的相互作用；此外，还增添了使用Bioperl模块进行数据分析和Windows操作系统下Bioperl程序包的安装等内容。《DNA和蛋白质序列数据分析工具(第2版)》中提及的各种方法均有充实的例证并附上相关数据和图表，供读者理解和参考；《DNA和蛋白质序列数据分析工具(第2版)》后还附有中英文的专业术语和词汇。